W.I.T.C.H. eli Will, Irma, Taranee, Cornelia, ja Hay Lin ovat täällä taas mukanaan uudet seikkailut täynnä mystiikkaa, jännitystä ja toimintaa! Tällä kertaa heidän tehtävänään on pysäyttää paha Phobos, joka etsii tyttöjen kotikaupungista erästä tiettyä henkilöä; omaa kadonnutta sisartaan. Phobos haluaa ottaa haltuunsa sisarensa salaiset voimat, jolloin kukaan ei voittaisi häntä. Kun W.I.T.C.H. -tytöt kauhukseen huomaavat, että sisar voisi olla joku heidän tuttunsa, alkaa heidän tähän saakka jännittävin ja vaarallisin seikkailunsa! ”W.I.T.C.H. – osa 2” sisältää neljä jännittävää jaksoa, joiden tapahtumapaikkana ovat erilaiset maailmat, joissa tytöt joutuvat käyttämään kaikkia yliluonnollisia voimiaan pahan ja hyvän ottaessa mittaa toisistaan!