Harmia tiedossa! Häijy tohtori Johannes von Hamsteri on paennut vankilasta ja pakottaa Jumban tekemään uuden koekappaleen – Leroyn, Stitchin ilkeän kaksoisolennon. Pahentaakseen asioita entisestään Hamsteri kloonaa Leroysta itselleen kokonaisen ilkiöarmeijan. Lilo saa selville, mitä on tekeillä ja päättää koota yhteen Stitchin ja muut ystävät, mikä on helpommin sanottu kuin tehty. Ystävykset nimittäin ovat hajallaan ympäri avaruutta! Kun Leroy ja tämän armeija ovat valmiina galaksin valtaamiseen, huomaavat ystävykset, että on vain yksi paikka, mihin he kaikki kuuluvat. Heidän tulee olla yhdessä.