Casey Jones, Nanobotti ja Kaupungin pimeydessä. Rafael ottaa yhteen Michelangelon kanssa ja lähtee sitten maan pinnalle viilentämään tunteitaan. Supervoimilla varustettu nanobotti pääsee vahingossa irti. Kaupunki on pimeyden vallassa ja mutanttikilpikonnat tutkivat syytä outoon ilmiöön.