Ash luulee nähneensä kaiken Pokémoneihin liittyvän, mutta onko hän valmis kohtaamaan mystisen Darkrain? Ash kiertää kauniin Alicen kanssa Alamos Townia, jossa sijaitsee Aika-avaruus -torni ja huomaa ystäviensä kanssa, että kaupungin ainutlaatuinen puutarha on tuhottu. Paroni Alberto, komea mutta ylimielinen nuorukainen, syyttää Darkraita hävityksestä kun mystinen Darkrai äkkiä ilmestyykin haastamaan sankarimme. Kuka Darkrai oikein on? Onko hän vihollinen? vai kenties valepukuinen ystävä? Legendaaristen Pokémonien Dialgan ja Palkian käydessä hurjaa taistelua Alamos Townin yläpuolella, jää nähtäväksi selviytyvätkö Ash ja hänen ystävänsä, ja saavatko he selville Darkrain todellisen luonnon?