Kun Khanina tunnettu mestaririkollinen julistaa yhden miehen sodan tähtilaivastoa vastaan, kapteeni Kirk, Spock sekä U.S.S. Enterprisen muu rohkea miehistö suuntaavat kaikkien aikojen räjähdysvaarallisimmalle ihmisjahdilleen. Maan puolustamiseen ja Khanin tappavan uhan eliminoimiseen vaaditaan kaikki heidän käytettävissään olevat keinot J.J. Abramsin toimintaseikkailussa.