Kun maailman vahvin mutantti, Apocalypse, herää tuhansien vuosien jälkeen ja huomaa ihmisten johtavan maailmaa, hän päättää vakaasti puhdistaa Maan ihmissuvusta. Pyrkiessään epätoivoisesti pelastamaan ihmiskunnan professori X johtaa nuoret X-Menit taisteluun, joka ratkaisee maailman kohtalon.